Dados do Trabalho

Título

Análise retrospectiva do perfil de infecção por SARS-CoV-2 em pacientes positivos para COVID-19 em Vitória da Conquista, Nordeste do Brasil

Introdução

A COVID-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2, é uma condição clínica cuja manifestação da gravidade dos sintomas é variável de acordo com o perfil demográfico da população estudada. Observou-se que muitos estudos focaram na disseminação da COVID-19 em grandes centros urbanos no Brasil e poucos avaliaram cidades médias ou pequenas da região Nordeste.

Objetivo (s)

Os objetivos deste estudo foram: identificar fatores de risco para mortalidade por infecção por SARS-CoV-2; avaliar os padrões de expressão gênica das principais vias de resposta imune de pacientes com COVID-19; e identificar as variantes circulantes do SARS-CoV-2 em residentes de uma cidade de médio porte do Nordeste do Brasil.

Material e Métodos

Este estudo incluiu um total de 783 pacientes diagnosticados para SARS-CoV-2 entre maio de 2020 e agosto de 2021. Os dados clínico-epidemiológicos de pacientes que tiveram o desfecho da doença entre recuperado e óbito foram comparados. Esses pacientes também foram divididos em três grupos com base na gravidade da doença: assintomático, leve e moderado/grave. Amostras de swab nasal pacientes de cada um desses grupos foram submetidas a análises de 84 genes envolvidos com as vias de resposta imune por qPCR array e sequenciadas usando Oxford Nanopore MinION.

Resultados e Conclusão

Foram identificados como fatores de risco para mortalidade: presença de comorbidade pré-existente, principalmente doença cardiovascular, diabetes e/ou doença pulmonar obstrutiva crônica; ser do sexo masculino; e apresentar valores de Ct (cycle threshold) no PCR para diagnóstico da infecção abaixo de 22. A análise dos perfis de expressão dos genes das vias inflamatórias mostrou que quanto maior a gravidade da infecção, maior a ativação das vias inflamatórias, desencadeando a tempestade de citocinas e diminuindo a regulação das vias anti-inflamatórias. A análise do genoma viral revelou a circulação de linhagens múltiplas, como B.1, B.1.1.28, Alpha e Gamma, sugerindo que vários eventos de introdução ocorreram ao longo do tempo. Este estudo ajudou a identificar as cepas específicas e aumentar nossa compreensão do verdadeiro estado de saúde local. Além disso, nossos dados demonstram que a vigilância epidemiológica e genômica juntas podem ajudar a formular estratégias de saúde pública para orientar ações governamentais.

Palavras-chave

SARS-CoV-2, expressão gênica, sequenciamento, vigilância genômica, vigilância epidemiológica

Agradecimentos

CAPES