Dados do Trabalho

Título

Vigilância genômica de arboviroses no Estado da Bahia durante o período de 2021 a 2023.

Introdução

A vigilância genômica das arboviroses urbanas (zika,dengue e chikungunya) se constitui em uma ferramenta robusta para subsidiar as ações voltadas para a vigilância à saúde, particularmente nas medidas de prevenção e controle de surtos e epidemias causadas por estes vírus.

Objetivo (s)

Identificar os genótipos circulantes dos vírus DENV-1, DENV-2 e CHIKV nos anos de 2021 à 2023 no Estado da Bahia.

Material e Métodos

Um total de 200 amostras foram analisadas, sendo 58 de DENV-1, 35 de DENV-2 e 107 de CHIKV correspondentes aos anos de 2021 (35), 2022 (95) e 2023 (70). Não houve amostra elegível para sequenciamento do ZIKAV no período estudado. O RNA das amostras foi extraído e o cDNA foi adquirido através do kit SuperScript IV. O cDNA foi então submetido ao kit diagnóstico ZDC para confirmação da infecção viral. As amostras foram submetidas a PCR com primers específicos para o genoma total de cada um dos vírus estudados (DENV-1, DENV-2 e CHIKV), então os produtos da PCR foram submetidos a purificação com o reagente AMPure XP beads e posteriormente as bibliotecas foram preparadas para o sequenciamento pelo Illumina MiSeq ou MINIon (Oxford Nanopore), de acordo com as orientações do fabricante. As sequências geradas foram analisadas utilizando o software Geneious 2022.2.1. A sequência consenso, juntamente com referências para os diversos genótipos dos vírus estudados, foram alinhadas utilizando o software MAFFT e foi feita a reconstrução filogenética por maximum likelihood utilizando o software IQTREE. As árvores foram visualizadas no software FigTree.

Resultados e Conclusão

Foi observado a presença do genótipo africano ECSA nas sequências de CHIKV, sem aparentes novas introduções no Estado. Para o vírus DENV-1 foi identificado apenas o genótipo V, sem aparentes introduções de outros genótipos no Estado durante o período estudado. Em relação ao DENV-2 foram identificados dois genótipos distintos, 13 amostras foram classificadas como genótipo III (Southern Asian-American) e 22 amostras classificadas como genótipo II (cosmopolita), introduzido no Brasil em 2022. As análises evolutivas em relação ao DENV-2 genótipo III sugerem que a reemergência do vírus no Estado da Bahia se deu através de múltiplas entradas e com sequencias agrupadas no clado BR-4. Os resultados obtidos da vigilância genômica das arboviroses demonstram a importância do monitoramento dos arbovírus circulantes, principalmente quando se trata da introdução de um novo genótipo.

Palavras-chave

DENV, CHIKV, ZIKAV, ARBOVIROSES, VIGILÂNCIA GENÔMICA,