Dados do Trabalho

Título

SEQUENCIAMENTO DO SARS-COV-2 E VIGILÂNCIA EPIDEMIOLÓGICA EM MATO GROSSO

Introdução

O SARS-CoV-2 é um vírus RNA de fita simples (+ ssRNA), polaridade positiva e não segmentada, sentido positivo, 5’-cap, 3’-poliadenilado e tamanho surpreendentemente grande, variando de 27 a 32 quilobases (2), pertencem à família Coronaviridae, gênero betacoronavirus, sendo designado como SARS-CoV-2. O genoma do SARS-CoV-2 codifica proteínas não estruturais e quatro proteínas estruturais como: espícula, envelope, membrana, nucleocapsídeo e várias proteínas acessórias . O método de sequenciamento genético permite realizar a leitura dos genomas virais com o objetivo de identificar novos patógenos e aprimorar a compreensão das origens e da transmissão de vírus emergentes. Sendo relevante acompanhar, monitorar e identificar a circulação das linhagens e sublinhagens de SARS-CoV-2 no Estado de Mato grosso (MT), tendo em vista que o vírus tem afinidade para sofrer mutações.

Objetivo (s)

Identificar e monitorar as variantes de SARS-CoV-2 que circulam no estado de Mato grosso, através sequenciamento genético por Ion torrente com amostras referente aos meses de 12/2022 a 03/2023.

Material e Métodos

As amostras obtidas foram submetidas a extração do RNA e amplificação do material genético pela técnica de RT-qPCR, aquelas positivas para SARS-CoV-2, foram encaminhadas para serem sequenciadas. As sequências genomicas obtidas foram analisadas utilizando o software do Ion torrent e Genome detective. A avaliação da linhagem foi realizada utilizando duas ferramentas Pangolin e Nextstrain.

Resultados e Conclusão

Sequenciamos 77 genomas , todos os casos apresentaram a variante Ômicron do SARS-CoV-2, indicando sua presença em 100% das amostras analisadas. Foram identificadas várias variantes em diferentes proporções. A sublinhagem BQ.1 foi a mais prevalente, representando 30% das amostras analisadas, seguida por XBB.1.18.1 (12%), XBB.1.5 (9%), BQ.1.1.31 (4%), BQ.1.1.11 (4%), BA.5.3.1 (6%), XBB.1.18 (6%), BN.3.1 (2%), BQ.1 (14%), BE.10 (1%), BQ.1.24 (1%), BQ.1.1.5 (1%), BE.9 (1%), DL.1 (1%), XBB.1.18 (1%), XBB.1.18.1 (1%), XBB.2 (1%), e XBJ.2 (1%). Isso sugere uma possível relação entre a alta transmissibilidade da variante e o número de infecções registradas no Estado de MT , bem como a ocorrência de eventos de importação e disseminação do vírus, sugerindo diversidade genética e a disseminação do vírus, contribuindo para a compreensão da epidemiologia local . Além disso, a ausência de medidas preventivas para conter a disseminação do vírus pode ter contribuído para a disseminação da variante Ômicron.

Palavras-chave

SARS-COV-2; VIGILÂNCIA