Dados do Trabalho

Título

INFLUENZA EM MATO GROSSO: UMA ABORDAGEM DE VIGILÂNCIA GENÔMICA

Introdução

A influenza é uma doença aguda do sistema respiratório causada pelo vírus Myxovirus influenzae - família Orthomyxoviridae - e tendo alta capacidade de transmissão e distribuição global, sendo dividida em três subtipos: M.influenza A, B e C. O que define os subtipos do vírus é a combinação das glicoproteínas de superfície do vírus a hemaglutinina (HA), e a neuraminidase (NA). A influenza é uma doença sazonal, com habilidade de causar epidemias anuais recorrentes, isto é possível devido à sua alta variabilidade e capacidade de adaptação do vírus que induz altas taxas de mutação durante a fase de replicação. Afim de explorar o senário epidemiológico do estado de Mato grosso, e rastrear as mutações do vírus influenza foi realizado vigilância genômica utilizando técnicas de NSG por formação de “pontes”, obtendo resultados rápidos que permite a definição de estratégias de intervenção individuais e coletivas junto a população

Objetivo (s)

Sequenciar amostras diagnosticadas positivas para influenza A pela técnica de RT-qPCR oriundas do LACEN-MT em parceria com instituto Butantã.

Material e Métodos

As amostras obtidas foram submetidas a extração do RNA e amplificação do material genético pela técnica de RT-qPCR, aquelas diagnosticadas positivas para influenza foram encaminhadas para serem sequenciadas. Nas analises de bioinformática Foram utilizados dois tipos de metodologias de montagem para o pipeline de influenza, a metodologia de Novo com o software spades e depois com uma montagem por referência utilizando a ferramenta BWA men.

Resultados e Conclusão

Um total de 84 amostras foram sequenciadas e posteriormente analisadas utilizados dois tipos de metodologias de montagem para o pipeline de influenza, a metodologia de Novo com o software spades e depois com uma montagem por referência utilizando a ferramenta BWA men. Obteve-se 78 amostras com cobertura > 85% e com profundidade maior que 10 bases. O genótipo da Influenza tipo A foi identificado 100% de H3N2 nas amostras. O vírus H3N2 é uma variante do vírus Influenza A, que é um dos principais responsáveis pelos surtos de gripe comum e pelos resfriados. Diante do potencial risco de ameaça de um vírus causar uma doença de grande magnitude, a vigilância desta doença precisa ser monitorada constantemente e seu perfil descrito para que as mudanças de padrões sejam utilizadas para uma tomada de decisão oportuna e eficaz.

Palavras-chave

Influenza, vigilância, vírus

Agradecimentos

LACEN-MT; INSTITUTO BUTANTAN